Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl7Q03366 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms