Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms