Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fgfr4Q03142 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms