Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1sQ02789 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1sQ02789 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms