Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms