Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ascl1Q02067 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms