Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VcpQ01853 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VcpQ01853 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms