Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EgfrQ01279 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms