Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms