Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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SeleQ00690 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SeleQ00690 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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SeleQ00690 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SeleQ00690 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SeleQ00690 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms