Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga4Q00651 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms