Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms