Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca2P97929 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brca2P97929 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms