Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlkP97793 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AlkP97793 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AlkP97793 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AlkP97793 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AlkP97793 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AlkP97793 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AlkP97793 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlkP97793 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlkP97793 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlkP97793 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlkP97793 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlkP97793 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlkP97793 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlkP97793 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlkP97793 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AlkP97793 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlkP97793 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlkP97793 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlkP97793 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlkP97793 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlkP97793 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlkP97793 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlkP97793 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlkP97793 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlkP97793 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AlkP97793 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlkP97793 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlkP97793 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlkP97793 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlkP97793 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlkP97793 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlkP97793 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms