Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2cP97760 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms