Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas2P97460 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas2P97460 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms