Protein–RNA interactions for Protein: P97382

Kcnab3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab3P97382 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab3P97382 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab3P97382 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms