Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms