Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms