Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms