Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cux2P70298 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux2P70298 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cux2P70298 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms