Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad54lP70270 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms