Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crnkl1P63154 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms