Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tra2bP62996 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tra2bP62996 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tra2bP62996 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tra2bP62996 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms