Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab3cP62823 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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