Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms