Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufm1P61961 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms