Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga11P61622 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga11P61622 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms