Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smg6P61406 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smg6P61406 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg6P61406 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg6P61406 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms