Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms