Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms