Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp1P60335 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp1P60335 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms