Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms