Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms