Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lim2P56563 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lim2P56563 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lim2P56563 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms