Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5bP56480 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms