Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms