Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp5P56399 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp5P56399 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp5P56399 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp5P56399 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms