Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Faf1P54731 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms