Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pms2P54279 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pms2P54279 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pms2P54279 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms