Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PctpP53808 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PctpP53808 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PctpP53808 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PctpP53808 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PctpP53808 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms