Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RoraP51448 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RoraP51448 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RoraP51448 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RoraP51448 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RoraP51448 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RoraP51448 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RoraP51448 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RoraP51448 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RoraP51448 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RoraP51448 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms