Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp3P49194 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp3P49194 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms