Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TgfaP48030 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TgfaP48030 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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