Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf4P43488 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms