Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx1P43345 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms