Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms