Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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