Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VhlP40338 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VhlP40338 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VhlP40338 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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