Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3rP40223 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.3 ms